目前，“公卫中心”形成了歌乐山院区、平顶山院区“一体两翼”新格局。歌乐山院区毗邻空气清新、风景秀美的歌乐山森林公园，主要承担传染病医疗救治任务和公共卫生传染病应急工作，在结核病和艾滋病的诊断治疗上有先进的技术水平，拥有全国知名专家和先进的各种仪器设备，可快速确诊并有效治疗结核病及艾滋病。开设科室有：结核内科（共设6个病区，分别为结核合并尘肺病区、结核合并糖尿病病区、耐药结核病病区、结核性脑膜脑炎病区、结核合并药物性肝损伤及重症结核病区）、感染科（设3个病区）、普内科、胸外科、普外与骨科、手术麻醉科、急诊科、重症医学科、中医科、药剂科、检验科、放射科、特检科及供应室等；平顶山院区交通便利，邻接小龙坎平顶山森林公园，主要承担综合性医疗救治任务，开设科室有：急诊医学科、消化肝病科、肾内内分泌科、呼吸老年科、心内神内科、外科（普外、骨科、泌尿、神外、皮肤）、康复医学科、妇产科、重症医学科、麻醉科、内镜室、血液净化室、药剂科、检验科、放射科、特检科、病理科等。 “公卫中心”集医、教、研、防为一体，是国家药物临床试验机构、国家中医药管理局“中医药防治传染病重点研究室”（临床基地）、中华传染病医院管理学会副理事长单位，遵义医学院教学医院，其中感染科和呼吸科（结核）获批重庆市临床重点专科建设项目，并设有重庆市博士后科研工作站、中心实验室和重庆市医学**后备人才工作室。先后主持并参与“十一五”、“十二五”、“十三五”国家科技重大专项及市科委、市卫生计生委各类立项科研项目70余项。与美国艾滋病健康教育基金会（ahf）、首都医科大学附属北京胸科医院以及陆军军医大学西南医院等科研院所及医疗机构建立了长期、友好合作关系。 我们正以“人才建院、依法治院、科技强院、文化兴院”的治院方针向着以传染病为特色，集临床、科研、教学为一体的重庆权威、西南前列、全国、影响全球的省级感染病救治中心和三级甲等综合性医院目标迈进。